اداره کل غذا، دارو و استاندارد قشم در سال 1374 در راستای اجرای ماده 4 قانون مقررات صادارات، واردات و امور گمرکی مناطق آزاد تجاری-صنعتی جمهوری اسلامی ایران، با نام واحد نظارت بر ضوابط بهداشت انسانی و استاندارد قشم در ساختمانی به مساحت تقریبی 100 متر مربع زیر نظر سازمان منطقه آزاد قشم فعاليت خود را آغاز نمود. در حال حاضر اين اداره کل با اخذ تفویض اختیار سازمان ملی استاندارد و سازمان غذا و دارو، در راستای اجرای اهداف و وظایف قانونی دو سازمان فعالیت می نماید.
اداره کل غذا، دارو و استاندارد قشم از اردیبهشت ماه 1398 با حکم رییس هیات مدیره و مدیرعامل سازمان منطقه آزاد قشم در خصوص انتصاب سرکارخانم مهندس نسرین نانوایی قشمی به عنوان سرپرست مدیریت غذا، دارو و استاندارد، با 15 نیرو فعالیت خود را شروع نموده و از مرداد ماه سال 1399 بعنوان مدیر غذا، دارو و استاندارد قشم فعالیت خود را ادامه می دهند.